氟化鈉用于治療骨質疏松時可出現：(1)胃腸道反應：發生率為40%-50%,可見胃痛、惡心、嘔吐、腹瀉、極少數有胃出血。(2)急性下肢疼痛綜合征：發生率為10%~40%，表現為關節周圍疼痛（多見于膝、踝和足部），可有大關節炎。(3)外周骨發生應力性骨折的可能性增加。

   氟化鈉用于預防齲齒時，攝人5~20mg可發生胃腸道不適。國外出現的不良反應：(1)代謝/內分泌系統可見甲狀腺功能低下，表現為虛弱、疲勞、勞力性呼吸困難。每日給予甲狀腺干片0。015~0。3g可改善癥狀。(2)肌肉骨骼系統可見關節痛或關節周圍疼痛（多見于踝和膝，足趾、手指、手腕和足跟亦有發生）。
  治療的第一年發生率較高，將日劑量減至30~40mg可減輕癥狀。血中氟離子濃度高于190mg/ml可出現風濕病。(3)腎臟可見慢性腎衰竭。(4)胃腸道可見惡心、嘔吐、食欲缺乏、腹瀉、微量出血。(5)血液骨髄中可出現單核巨噬細胞及移行的巨噬細胞。